یخچال‌های طبیعی افغانستان در فاصله‌ی ۱۹۹۰ تا ۲۰۱۵ حدود ۱۳.۸ درصد، یعنی ۴۰۶ کیلومترمربع از مساحت خود را از دست داده ‌اند؛ در حالی که ۹۲ درصد مساحت یخچال‌های کشور در حوزهی پنج‌آمو متمرکز است و مدل‌های اقلیمی کاهش ۱۰ تا ۲۰درصدی جریان آب آمو را در دهه‌های آینده محتمل می‌دانند. با این حال، افغانستان هنوز در سال ۲۰۲۶ آمار دقیق و سراسری از وضعیت کنونی یخچال‌هایش ندارد. کوهستان‌های پامیر و واخان در بدخشان، یکی از مهم‌ترین مناطق یخچالی افغانستان و بخش بالادست حوزه‌ی آب‌ریز پنج‌آمو به شمار می‌روند.